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粪肥是一种有机肥料，因其能够改良土壤而在农业中常用。虽然粪便由许多有助于植物生长的营养成分组成，但其中还包含农民和园丁在施用前需要考虑的其他元素。粪便通常取自动物，如牛、猪、鸡和马。
粪便中可能会发现杂草种子。这些种子可能会被动物吃掉，并在通过消化道时保持活力。粪便中的杂草种子可能会将新的杂草引入土壤。能够通过消化存活的杂草种子类型是猪草和羔羊草。土壤中的杂草会吸收养分并限制其他植物的生长。
大肠杆菌可以通过粪便传播，这种细菌可能会在蔬菜中爆发。农民和园丁需要注意在生菜、土豆、萝卜、西红柿、胡萝卜和甜菜上撒粪。大肠杆菌是一种生活在动物肠道内的细菌，可能会导致生蔬菜污染。虽然存在有害细菌菌株，但接触大肠杆菌通常会导致腹泻或腹部绞痛。
粪便中也普遍含有盐，随着时间的推移，盐会在土壤中积聚。土壤中的高盐分会造成干燥条件并损害植物的根部。当树木和植物种植在高浓度盐的土壤中时，也可能会受到疾病的影响。这可能会导致植物和树木死亡或无法充分发挥其潜力。
施肥是一项劳动密集型工作，而且这还是在扣除运输成本之后。为了为农场或花园获得足够数量的粪便，您必须将粪便从一个地方拖到另一个地方。为了抵消成本，制定了粪便运输计划，将粪便从动物生产者运输到农场。虽然这可能有助于促进粪便的运输，但它需要花钱。成本可能取决于粪便量和运输距离。
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